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      NumPy 与 Python 内置列表计算标准差的区别

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      NumPy 与 Python 内置列表计算标准差的区别

      2024-08-08 09:40:21 阅读次数:34

      python,编程开发

      1 什么是 Numpy

      NumPy,是 Numerical Python 的简称,用于高性能科学计算和数据分析的基础包,像数学科学工具(pandas)和框架(Scikit-learn)中都使用到了 NumPy 这个包。

      NumPy 中的基本数据结构是 ​​ndarray​​ 或者 N 维数值数组,在形式上来说,它的结构有点像 Python 的基础类型——Python列表。

      但本质上,这两者并不同,可以看到一个简单的对比。

      我们创建两个列表,当我们创建好了之后,可以使用 ​​+​​ 运算符进行连接:

      list1 = [i for i in range(1,11)]
      list2 = [i**2 for i in range(1,11)]
      print(list1+list2)
      # [1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 1, 4, 9, 16, 25, 36, 49, 64, 81, 100]

      列表中元素的处理感觉像对象,不是很数字,不是吗? 如果这些是数字向量而不是简单的数字列表,您会期望 + 运算符的行为略有不同,并将第一个列表中的数字按元素添加到第二个列表中的相应数字中。

      接下来看一下 Nympy 的数组版本:

      import numpy as np
      arr1 = np.array(list1)
      arr2 = np.array(list2)
      arr1 + arr2
      # array([ 2, 6, 12, 20, 30, 42, 56, 72, 90, 110])

      通过 numpy 的 ​​np.array​​ 数组方法实现了两个列表内的逐个值进行相加。

      我们通过 ​​dir​​​ 函数来看两者的区别,先看 Python 内置列表 ​​list1​​ 的内置方法:

      NumPy 与 Python 内置列表计算标准差的区别

      再用同样的方法看一下 ​​arr1​​ 中的方法:

      NumPy 与 Python 内置列表计算标准差的区别

      NumPy 数组对象还有更多可用的函数和属性。 特别要注意诸如 ​​mean​​​、​​std​​​ 和 ​​sum​​ 之类的方法,因为它们清楚地表明重点关注使用这种数组对象的数值/统计计算。 而且这些操作也很快。

      2 NumPy 数组和 Python 内置计算对比

      NumPy 的速度要快得多,因为它的矢量化实现以及它的许多核心例程最初是用 C 语言(基于 CPython 框架)编写的。 NumPy 数组是同构类型的密集排列的数组。 相比之下,Python 列表是指向对象的指针数组,即使它们都属于同一类型。 因此,我们得到了参考局部性的好处。

      许多 NumPy 操作是用 C 语言实现的,避免了 Python 中的循环、指针间接和逐元素动态类型检查的一般成本。 特别是,速度的提升取决于您正在执行的操作。 对于数据科学和 ML 任务,这是一个无价的优势,因为它避免了长和多维数组中的循环。

      让我们使用 ​​@timing​​​ 计时装饰器来说明这一点。 这是一个围绕两个函数 ​​std_dev​​​ 和 ​​std_dev_python​​ 包装装饰器的代码,分别使用 NumPy 和本机 Python 代码实现列表/数组的标准差计算。

      3 函数计算时间装饰器

      我们可以使用 Python 装饰器和 ​​functools​​ 模块的 ​​wrapping​​ 来写一个 时间装饰器 ​​timing​​:

      def timing(func):
      @wraps(func)
      def wrap(*args, **kw):
      begin_time = time()
      result = func(*args, **kw)
      end_time = time()

      print(f"Function '{func.__name__}' took {end_time-begin_time} seconds to run")
      return result
      return wrap

      4 标准差计算公式

      然后利用这个时间装饰器来看 Numpy 数组和 Python 内置的列表,然后计算他们的标准差,公式如图:

      NumPy 与 Python 内置列表计算标准差的区别

      1. 定义 Numpy 计算标准差的函数std_dev(),numpy 模块中内置了标准差公式的函数 a.std(),我们可以直接调用
      2. 列表计算公式方法需要按照公式一步一步计算:
      1. 先求求出宗和s
      2. 然后求出平均值average
      3. 计算每个数值与平均值的差的平方,再求和sumsq
      4. 再求出sumsq 的平均值 sumsq_average
      5. 得到最终的标准差结果result

      代码如下:

      from functools import wraps
      from time import time
      import numpy as np
      from math import sqrt


      def timing(func):
      @wraps(func)
      def wrap(*args, **kw):
      begin_time = time()
      result = func(*args, **kw)
      end_time = time()
      # print(f"Function '{func.__name__}' with arguments {args},keywords {kw} took {end_time-begin_time} seconds to run")
      print(f"Function '{func.__name__}' took {end_time-begin_time} seconds to run")
      return result
      return wrap

      @timing
      def std_dev(a):
      if isinstance(a, list):
      a = np.array(a)
      s = a.std()
      return s

      @timing
      def std_dev_python(lst):

      length = len(lst)
      s = sum(lst)
      average = s / length

      sumsq = 0
      for i in lst:
      sumsq += (i-average)**2
      sumsq_average = sumsq/length
      result = sqrt(sumsq_average)
      return result

      运行结果,最终可以看到 1000000 个值得标准差的值为 288675.13459,而 Numpy 计算时间为 0.0080 s,而 Python 原生计算方式为 0.2499 s:

      NumPy 与 Python 内置列表计算标准差的区别

      由此可见,Numpy 的方式明显更快。

      5 总结

      NumPy 是专门针对数组的操作和运算进行了设计,所以数组的存储效率和输入输出性能远优于Python中的嵌套列表,数组越大,NumPy的优势就越明显。

      NumPy 还提供了一系列让人眼前一亮的函数,可以用于高级数据科学和机器学习的数值数组和矩阵,今后我们再一一进行探索和学习!

      版权声明:本文内容来自第三方投稿或授权转载,原文地址:https://blog.51cto.com/yuzhou1su/5456245,作者:宇宙之一粟,版权归原作者所有。本网站转在其作品的目的在于传递更多信息,不拥有版权,亦不承担相应法律责任。如因作品内容、版权等问题需要同本网站联系,请发邮件至ctyunbbs@chinatelecom.cn沟通。

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