使用VASP软件做分子动力学模拟 天翼云弹性高性能计算支持使用VASP软件做分子动力学模拟,本文为您介绍该应用场景下的操作步骤。 背景信息 VASP全称Vienna Abinitio Simulation Package,VASP是维也纳大学Hafner小组开发的进行电子结构计算和量子力学分子动力学模拟软件包。它是材料模拟和计算物质科学研究中最流行的软件之一。 准备工作 已创建弹性高性能计算EHPC集群。 已创建集群用户。 需要安装的软件:Intel OneAPI 2022、VASP 5.4.4。 操作步骤 1.登录EHPC集群,安装VASP 5.4.4。 plain 加载 intel OneAPI 环境变量; source /opt/intel/oneapi/setvars.sh 进入vasp安装包目录 cd /opt/vasp.5.4.4 准备编译配置文件 cp arch/makefile.include.linuxintel ./makefile.include 根据需要,选择编译的模块 std表示标准模块,all编译所有模块 make std 编译完成后,会生成对应的应用程序可执行文件: 2.作业提交 准备测试文件,将vaspstd拷贝到作业目录下,使用hpcuser用户提交任务: 创建Slurm脚本 submit.sh,使用2台节点,每节点使用16核: plain