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          本页目录

          帮助中心科研助手最佳实践在科研助手上使用并行计算训练模型
          在科研助手上使用并行计算训练模型
          更新时间 2025-04-01 20:37:34
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          引言

          科研助手【科研版】提供并行计算功能模块,您可以基于该能力模块运行分布式作业。我们提供多种运行引擎的支持,您可以根据自己的需要使用不同的训练引擎。同时,我们也提供多个区域不同种类的算力,您可以根据需要按需选购。

          01.png

          场景描述

          本文将通过使用 PyTorch框架训练手写数字识别 MNIST 模型来讲述如何在科研助手并行计算模块中训练模型。

          手写数字MNIST 数据集是一个经典的手写数字图像数据集,广泛用于机器学习和深度学习领域的模型训练与评估。它包含60,000 张训练图像和 10,000 张测试图像,每张图像为 28×28 的灰度图,涵盖手写数字 0 到 9。MNIST数据集因其简单性和代表性,成为算法验证和教学的经典工具,支持多种机器学习方法和深度学习模型的开发与测试。

          本场景的整体流程如下:

          02.png

          准备工作

          准备工作包括如下几步:

          • 准备数据:准备训练代码、训练数据、训练环境
          • 创建科研文件:科研文件是科研助手提供的文件管理服务,并行计算需要依赖科研文件将数据挂载到训练任务中
          • 上传数据:将准备好的数据上传到科研文件实例

          数据准备

          数据包括训练代码、训练数据和训练环境。

          1、训练代码

          本示例的训练代码包括两部分,如下所述:

          (1)启动脚本

          本示例提供一个启动脚本start.sh,可以简化创建任务填写的启动命令内容。内容如下:

          sudo /opt/conda/bin/python3 /storage/mnist/bc_mnist.py
          

          您可以按照实际情况调整启动脚本的内容。

          (2)模型训练代码

          本示例的训练代码包括训练和验证两部分内容,参考官方提供的示例代码进行改写。bc_mnist.py 内容如下:

          from __future__ import print_function
          import argparse
          import os
          import torch
          import torch.nn as nn
          import torch.nn.functional as F
          import torch.optim as optim
          import torch.onnx
          from torchvision import datasets, transforms
          from torch.optim.lr_scheduler import StepLR
           
           
          class Net(nn.Module):
              def __init__(self):
                  super(Net, self).__init__()
                  self.conv1 = nn.Conv2d(1, 32, 3, 1)
                  self.conv2 = nn.Conv2d(32, 64, 3, 1)
                  self.dropout1 = nn.Dropout(0.25)
                  self.dropout2 = nn.Dropout(0.5)
                  self.fc1 = nn.Linear(9216, 128)
                  self.fc2 = nn.Linear(128, 10)
           
              def forward(self, x):
                  x = self.conv1(x)
                  x = F.relu(x)
                  x = self.conv2(x)
                  x = F.relu(x)
                  x = F.max_pool2d(x, 2)
                  x = self.dropout1(x)
                  x = torch.flatten(x, 1)
                  x = self.fc1(x)
                  x = F.relu(x)
                  x = self.dropout2(x)
                  x = self.fc2(x)
                  output = F.log_softmax(x, dim=1)
                  return output
           
           
          def train(args, model, device, train_loader, optimizer, epoch):
              model.train()
              for batch_idx, (data, target) in enumerate(train_loader):
                  data, target = data.to(device), target.to(device)
                  optimizer.zero_grad()
                  output = model(data)
                  loss = F.nll_loss(output, target)
                  loss.backward()
                  optimizer.step()
                  if batch_idx % args.log_interval == 0:
                      print('Train Epoch: {} [{}/{} ({:.0f}%)]\tLoss: {:.6f}'.format(
                          epoch, batch_idx * len(data), len(train_loader.dataset),
                          100. * batch_idx / len(train_loader), loss.item()))
                      if args.dry_run:
                          break
           
           
          def test(model, device, test_loader):
              model.eval()
              test_loss = 0
              correct = 0
              with torch.no_grad():
                  for data, target in test_loader:
                      data, target = data.to(device), target.to(device)
                      output = model(data)
                      test_loss += F.nll_loss(output, target, reduction='sum').item()  # sum up batch loss
                      pred = output.argmax(dim=1, keepdim=True)  # get the index of the max log-probability
                      correct += pred.eq(target.view_as(pred)).sum().item()
           
              test_loss /= len(test_loader.dataset)
           
              print('\nTest set: Average loss: {:.4f}, Accuracy: {}/{} ({:.0f}%)\n'.format(
                  test_loss, correct, len(test_loader.dataset),
                  100. * correct / len(test_loader.dataset)))
           
           
          def main():
              # Training settings
              parser = argparse.ArgumentParser(description='PyTorch MNIST Example')
              parser.add_argument('--batch-size', type=int, default=64, metavar='N',
                                  help='input batch size for training (default: 64)')
              parser.add_argument('--test-batch-size', type=int, default=1000, metavar='N',
                                  help='input batch size for testing (default: 1000)')
              parser.add_argument('--epochs', type=int, default=5, metavar='N',
                                  help='number of epochs to train (default: 5)')
              parser.add_argument('--lr', type=float, default=1.0, metavar='LR',
                                  help='learning rate (default: 1.0)')
              parser.add_argument('--gamma', type=float, default=0.7, metavar='M',
                                  help='Learning rate step gamma (default: 0.7)')
              parser.add_argument('--no-cuda', action='store_true', default=False,
                                  help='disables CUDA training')
              parser.add_argument('--dry-run', action='store_true', default=False,
                                  help='quickly check a single pass')
              parser.add_argument('--seed', type=int, default=1, metavar='S',
                                  help='random seed (default: 1)')
              parser.add_argument('--log-interval', type=int, default=10, metavar='N',
                                  help='how many batches to wait before logging training status')
              parser.add_argument('--save-model', action='store_true', default=True,
                                  help='For Saving the current Model')
              args = parser.parse_args()
              use_cuda = not args.no_cuda and torch.cuda.is_available()
              print("use_cuda: {}".format(use_cuda))
           
              torch.manual_seed(args.seed)
           
              device = torch.device("cuda" if use_cuda else "cpu")
           
              train_kwargs = {'batch_size': args.batch_size}
              test_kwargs = {'batch_size': args.test_batch_size}
              if use_cuda:
                  cuda_kwargs = {'num_workers': 1,
                                 'pin_memory': True,
                                 'shuffle': True}
                  train_kwargs.update(cuda_kwargs)
                  test_kwargs.update(cuda_kwargs)
           
              transform=transforms.Compose([
                  transforms.ToTensor(),
                  transforms.Normalize((0.1307,), (0.3081,))
                  ])
              dataset1 = datasets.MNIST('/storage/mnist/data', train=True, download=True,
                                 transform=transform)
              dataset2 = datasets.MNIST('/storage/mnist/data', train=False,
                                 transform=transform)
              train_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset1,**train_kwargs)
              test_loader = torch.utils.data.DataLoader(dataset2, **test_kwargs)
              print("Dataloader done")
           
              model = Net().to(device)
              optimizer = optim.Adadelta(model.parameters(), lr=args.lr)
              print("modeldone")
           
              scheduler = StepLR(optimizer, step_size=1, gamma=args.gamma)
              for epoch in range(1, args.epochs + 1):
                  train(args, model, device, train_loader, optimizer, epoch)
                  test(model, device, test_loader)
                  scheduler.step()
              print("train done")
           
              if args.save_model:
                  out_dir = "/storage/mnist/model/m/1/"
                  if not os.path.isdir(out_dir):
                      os.makedirs(out_dir)
                  # 保存模型
                  model_path = out_dir + "mnist_model.pth"
                  torch.save(model.state_dict(), model_path)
                  print("模型已保存到 {}".format(model_path))
           
              # 加载模型
              print("加载模型...")
              model = Net()  # 创建新的模型实例
              model.load_state_dict(torch.load(model_path))  # 加载保存的权重
              model.eval()  # 设置为评估模式
             
              # 测试模型
              print("开始测试...")
              with torch.no_grad():
                  for images, labels in test_loader:
                      # 获取第一批数据中的第一张图片和标签
                      image = images[0].unsqueeze(0)  # 添加一个批次维度
                      true_label = labels[0].item()
           
                      # 进行预测
                      output = model(image)
                      _, predicted_label = torch.max(output, 1)
                      predicted_label = predicted_label.item()
           
                      # 打印结果
                      print(f"真实标签: {true_label}")
                      print(f"预测标签: {predicted_label}")
                      break  # 只处理一张图片
           
          if __name__ == '__main__':
              main()
          

          您可以根据实际情况调整模型训练代码。

          2、数据准备

          本示例使用的是官方提供的MNIST 数据集。

          【注意】训练代码中有配置自动下载代码的选项,如果没有提前下载数据,也支持自动下载。您可以按照实际情况上传模型训练需要的数据。

          创建科研文件

          【科研文件】是科研助手提供的文件管理服务模块,您可以通过【科研文件】来管理自己的数据。并行计算需要依赖【科研文件】提供训练所需数据,因此需要提前创建科研文件。

          进入科研助手,选择【数据存储】>【科研文件管理】,点击【创建科研文件】按钮

          03.png

          科研文件目前仅支持【厦门4】可用区,您需要注意选择对应的资源池【huanan001-xxx】。科研文件默认最小容量为10G,您可以按需调整所需容量。

          04.png

          配置后,点击【确认订单】,等待科研文件状态变为【创建成功】

          1.png

          上传数据

          选择刚刚创建好的科研文件,点击【查看】,进入文件管理界面。

          新建一个目录,本示例命名为mnist。进入目录上传准备好的训练脚本、训练数据。

          2.png

          【注意】

          • 数据上传过程中,请保持网络畅通
          • 数据上传过程中,不要刷新页面,否则会导致上传文件丢失

          MNIST 手写识别模型训练

          准备工作做完后,进入【并行计算】页面,点击【创建计算任务】按钮,进入任务配置页面。

          3.png

          【注意】并行计算内置了一些可以直接使用的模板,您可以按需使用。

          在任务配置页面,本示例的配置如下:

          • 选择 PyTorch 训练框架
          • 镜像地址:本示例使用科研助手公共的 PyTorch 镜像(该镜像需要使用本示例启动脚本对应的 python 命令),地址为:ehub-bc.ctcdn.cn/esx-batchcom/jupyter-pytorch2.3.1-cuda12.1-cudnn8
          • 启动执行命令:sh /storage/mnist/start.sh
          • 可用区:需要与科研文件在同一个可用区:厦门4
          • 实例规格:可以按照实际需求选择
          • 容器挂载路径,需要与训练脚本中使用的路径相对应:/storage

          配置后,点【立即创建】

          11.png

          4.png

          可以点击右侧的【详情】按钮查看任务运行情况。

          并行计算提供多种能力来跟踪任务运行情况,包括:

          • 作业日志:可以查看任务运行过程中产生的训练日志
          • 实例终端:可以登录任务运行容器查看训练过程中产生的中间数据
          • 运行监控:可以查看任务运行过程的资源占用情况
          • 实例事件:可以查看任务运行过程中所产生的事件列表

          作业日志如下:

          5.png

          实例终端如下:

          6.png

          运行监控如下:

          7.png

          实例事件如下:

          8.png

          最终运行效果,模型成功训练,将模型保存到科研文件。通过保存的模型文件,能够正确识别手写识别数字。效果如下:

          9.png

          保存到科研文件的模型文件如下:

          10.png

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